《口袋妖怪红宝石》中除水系主宠外其他水系精灵可以通过垂钓、水面冲浪遇敌、潜水水下遇敌等当时遇到水系精灵从而进行捕捉。不仅是红宝石任何一款口袋系列游戏均可通过这些方式捕获水系精灵。

1、垂钓：使用破钓竿/好钓竿/超级钓竿在水边/水面上垂钓可掉到水系精灵。

2、水面冲浪：使用习得冲浪术的精灵在水边使用冲浪术后，可在水面上移动可随机遇到部分水系精灵。

3、水下遇怪：在特定地点使用潜水术后，可下潜至水下，在水下草丛移动可随机遇到水系精灵。